يستند هذا التقرير إلى الشهادات التي جمعتها بعثة تحقيق ميدانية أوفدتها المبادرة المصرية للحقوق الشخصية إلى مركز نجع حمادي في 12 و13 يناير 2010، وتشكلت من أحمد محجوب وإسحق إبراهيم. وقد زارت البعثة كلاً من مدينة نجع حمادي وقرية بهجورة وعزبة تركس، حيث حصلت على إفادات من شهود العيان، والمصابين، وأقارب الضحايا، ورجال الدين. كما اعتمد التقرير على مشاهدات الصحفي نادر شكري، والذي تواجد في نجع حمادي وبهجورة في الفترة من 7-9 يناير 2010. وأجرى باحثو المبادرة المصرية مقابلات عن طريق الهاتف مع بعض الشهود الذين لم تتمكن البعثة من لقائهم في نجع حمادي، وكذلك مع عدد من المصابين في اعتداءات 6 يناير، والذين يتلقون العلاج في مدينة سوهاج.
قامت المبادرة المصرية بحجب أسماء أغلب الشهود الذين حصلت على إفادات منهم، إما بناء على طلبهم أو حفاظاً على سلامتهم. بينما استخدمت الأسماء الحقيقية للقتلى والمصابين وأصحاب المحال التجارية التي تعرضت لاعتداءات تم إثباتها في محاضر رسمية. ويلتزم التقرير بعرض الأقوال كما جاءت على ألسنة الشهود، ما عدا التدخل أحياناً لاستخدام العربية الفصحى بدلاً من العامية.